根腐病在小麦各生育期均可发生，可危害植株各部位，表现根部腐烂、叶片出现病斑、茎枯死、穗颈枯死等症状。苗期发病，小麦芽鞘和根部变褐色甚至腐烂。发病轻的植株生长细弱，不久枯死；发病严重的幼芽不能出土便枯死。分蘖期病株根颈部出现褐色病斑，叶鞘也变褐腐烂，无效分蘖增多、丛生，严重时幼苗枯死。生长后期发病，病株易拔起，但不见根系腐烂，引起倒伏